Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SMARCA4P51532 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SMARCA4P51532 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SMARCA4P51532 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SMARCA4P51532 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SMARCA4P51532 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SMARCA4P51532 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SMARCA4P51532 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SMARCA4P51532 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SMARCA4P51532 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
SMARCA4P51532 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SMARCA4P51532 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SMARCA4P51532 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SMARCA4P51532 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SMARCA4P51532 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SMARCA4P51532 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SMARCA4P51532 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SMARCA4P51532 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SMARCA4P51532 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
SMARCA4P51532 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SMARCA4P51532 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SMARCA4P51532 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SMARCA4P51532 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SMARCA4P51532 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SMARCA4P51532 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SMARCA4P51532 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SMARCA4P51532 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SMARCA4P51532 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SMARCA4P51532 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SMARCA4P51532 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SMARCA4P51532 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SMARCA4P51532 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
SMARCA4P51532 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
SMARCA4P51532 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SMARCA4P51532 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SMARCA4P51532 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SMARCA4P51532 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SMARCA4P51532 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SMARCA4P51532 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
SMARCA4P51532 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SMARCA4P51532 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SMARCA4P51532 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SMARCA4P51532 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SMARCA4P51532 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SMARCA4P51532 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SMARCA4P51532 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SMARCA4P51532 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SMARCA4P51532 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SMARCA4P51532 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SMARCA4P51532 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SMARCA4P51532 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SMARCA4P51532 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SMARCA4P51532 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SMARCA4P51532 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SMARCA4P51532 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SMARCA4P51532 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SMARCA4P51532 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SMARCA4P51532 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SMARCA4P51532 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SMARCA4P51532 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SMARCA4P51532 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SMARCA4P51532 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SMARCA4P51532 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SMARCA4P51532 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SMARCA4P51532 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SMARCA4P51532 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SMARCA4P51532 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SMARCA4P51532 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SMARCA4P51532 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SMARCA4P51532 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SMARCA4P51532 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SMARCA4P51532 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SMARCA4P51532 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SMARCA4P51532 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SMARCA4P51532 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SMARCA4P51532 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SMARCA4P51532 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SMARCA4P51532 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SMARCA4P51532 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SMARCA4P51532 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SMARCA4P51532 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SMARCA4P51532 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SMARCA4P51532 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SMARCA4P51532 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SMARCA4P51532 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SMARCA4P51532 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SMARCA4P51532 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SMARCA4P51532 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SMARCA4P51532 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SMARCA4P51532 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SMARCA4P51532 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SMARCA4P51532 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SMARCA4P51532 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SMARCA4P51532 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SMARCA4P51532 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SMARCA4P51532 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SMARCA4P51532 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SMARCA4P51532 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SMARCA4P51532 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SMARCA4P51532 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms