Protein–RNA interactions for Protein: P43005

SLC1A1, Excitatory amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A1P43005 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms