Protein–RNA interactions for Protein: P43004

SLC1A2, Excitatory amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A2P43004 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms