Protein–RNA interactions for Protein: P28074

PSMB5, Proteasome subunit beta type-5, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB5P28074 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms