Protein–RNA interactions for Protein: P19838

NFKB1, Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB1P19838 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NFKB1P19838 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NFKB1P19838 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NFKB1P19838 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NFKB1P19838 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NFKB1P19838 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NFKB1P19838 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NFKB1P19838 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NFKB1P19838 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NFKB1P19838 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NFKB1P19838 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NFKB1P19838 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NFKB1P19838 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NFKB1P19838 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NFKB1P19838 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NFKB1P19838 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NFKB1P19838 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NFKB1P19838 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NFKB1P19838 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NFKB1P19838 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NFKB1P19838 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NFKB1P19838 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NFKB1P19838 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NFKB1P19838 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NFKB1P19838 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NFKB1P19838 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NFKB1P19838 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NFKB1P19838 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NFKB1P19838 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NFKB1P19838 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NFKB1P19838 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NFKB1P19838 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NFKB1P19838 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NFKB1P19838 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NFKB1P19838 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NFKB1P19838 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NFKB1P19838 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NFKB1P19838 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NFKB1P19838 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NFKB1P19838 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NFKB1P19838 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NFKB1P19838 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NFKB1P19838 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NFKB1P19838 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NFKB1P19838 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NFKB1P19838 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NFKB1P19838 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NFKB1P19838 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NFKB1P19838 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NFKB1P19838 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NFKB1P19838 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NFKB1P19838 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NFKB1P19838 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NFKB1P19838 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NFKB1P19838 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NFKB1P19838 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NFKB1P19838 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NFKB1P19838 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NFKB1P19838 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NFKB1P19838 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NFKB1P19838 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NFKB1P19838 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NFKB1P19838 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NFKB1P19838 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NFKB1P19838 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NFKB1P19838 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NFKB1P19838 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NFKB1P19838 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NFKB1P19838 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NFKB1P19838 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NFKB1P19838 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NFKB1P19838 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NFKB1P19838 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NFKB1P19838 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NFKB1P19838 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NFKB1P19838 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NFKB1P19838 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NFKB1P19838 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NFKB1P19838 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NFKB1P19838 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NFKB1P19838 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NFKB1P19838 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NFKB1P19838 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NFKB1P19838 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NFKB1P19838 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NFKB1P19838 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NFKB1P19838 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NFKB1P19838 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NFKB1P19838 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NFKB1P19838 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NFKB1P19838 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NFKB1P19838 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NFKB1P19838 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NFKB1P19838 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NFKB1P19838 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NFKB1P19838 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NFKB1P19838 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NFKB1P19838 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NFKB1P19838 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NFKB1P19838 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms