Protein–RNA interactions for Protein: P13747

HLA-E, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain E, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-EP13747 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-EP13747 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-EP13747 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-EP13747 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-EP13747 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-EP13747 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-EP13747 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-EP13747 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-EP13747 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-EP13747 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-EP13747 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-EP13747 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-EP13747 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-EP13747 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-EP13747 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-EP13747 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-EP13747 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-EP13747 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-EP13747 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-EP13747 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-EP13747 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-EP13747 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-EP13747 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-EP13747 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-EP13747 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-EP13747 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-EP13747 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-EP13747 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-EP13747 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-EP13747 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-EP13747 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-EP13747 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-EP13747 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-EP13747 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-EP13747 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-EP13747 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-EP13747 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-EP13747 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-EP13747 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-EP13747 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-EP13747 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-EP13747 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-EP13747 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-EP13747 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-EP13747 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-EP13747 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-EP13747 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-EP13747 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-EP13747 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-EP13747 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-EP13747 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-EP13747 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-EP13747 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-EP13747 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-EP13747 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-EP13747 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-EP13747 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-EP13747 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-EP13747 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-EP13747 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-EP13747 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-EP13747 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-EP13747 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-EP13747 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-EP13747 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-EP13747 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-EP13747 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-EP13747 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-EP13747 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-EP13747 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-EP13747 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-EP13747 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-EP13747 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-EP13747 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-EP13747 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-EP13747 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-EP13747 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-EP13747 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-EP13747 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-EP13747 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-EP13747 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-EP13747 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-EP13747 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-EP13747 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-EP13747 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-EP13747 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-EP13747 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-EP13747 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-EP13747 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-EP13747 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-EP13747 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-EP13747 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-EP13747 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-EP13747 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-EP13747 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-EP13747 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-EP13747 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-EP13747 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-EP13747 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-EP13747 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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