Protein–RNA interactions for Protein: P13727

PRG2, Bone marrow proteoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG2P13727 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRG2P13727 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRG2P13727 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRG2P13727 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PRG2P13727 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRG2P13727 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRG2P13727 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRG2P13727 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRG2P13727 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PRG2P13727 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRG2P13727 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRG2P13727 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRG2P13727 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PRG2P13727 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRG2P13727 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRG2P13727 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRG2P13727 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRG2P13727 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRG2P13727 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRG2P13727 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRG2P13727 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRG2P13727 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRG2P13727 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRG2P13727 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRG2P13727 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRG2P13727 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRG2P13727 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRG2P13727 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRG2P13727 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRG2P13727 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRG2P13727 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRG2P13727 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRG2P13727 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRG2P13727 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRG2P13727 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRG2P13727 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRG2P13727 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRG2P13727 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PRG2P13727 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRG2P13727 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRG2P13727 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRG2P13727 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRG2P13727 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRG2P13727 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRG2P13727 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRG2P13727 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PRG2P13727 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRG2P13727 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRG2P13727 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRG2P13727 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PRG2P13727 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRG2P13727 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRG2P13727 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRG2P13727 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PRG2P13727 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PRG2P13727 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRG2P13727 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PRG2P13727 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRG2P13727 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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PRG2P13727 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRG2P13727 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRG2P13727 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRG2P13727 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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PRG2P13727 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRG2P13727 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRG2P13727 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRG2P13727 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRG2P13727 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PRG2P13727 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PRG2P13727 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
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PRG2P13727 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PRG2P13727 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRG2P13727 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRG2P13727 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRG2P13727 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PRG2P13727 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRG2P13727 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRG2P13727 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRG2P13727 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRG2P13727 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRG2P13727 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRG2P13727 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRG2P13727 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRG2P13727 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRG2P13727 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRG2P13727 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRG2P13727 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRG2P13727 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PRG2P13727 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRG2P13727 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRG2P13727 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRG2P13727 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRG2P13727 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRG2P13727 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRG2P13727 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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