Protein–RNA interactions for Protein: P0CW27

CCDC166, Coiled-coil domain-containing protein 166, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC166P0CW27 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC166P0CW27 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC166P0CW27 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC166P0CW27 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC166P0CW27 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC166P0CW27 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC166P0CW27 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC166P0CW27 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC166P0CW27 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC166P0CW27 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC166P0CW27 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC166P0CW27 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC166P0CW27 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC166P0CW27 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC166P0CW27 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC166P0CW27 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC166P0CW27 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC166P0CW27 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC166P0CW27 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC166P0CW27 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC166P0CW27 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC166P0CW27 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC166P0CW27 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC166P0CW27 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC166P0CW27 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC166P0CW27 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC166P0CW27 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC166P0CW27 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC166P0CW27 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC166P0CW27 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC166P0CW27 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC166P0CW27 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC166P0CW27 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC166P0CW27 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC166P0CW27 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC166P0CW27 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC166P0CW27 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC166P0CW27 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC166P0CW27 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC166P0CW27 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC166P0CW27 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC166P0CW27 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC166P0CW27 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC166P0CW27 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC166P0CW27 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC166P0CW27 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC166P0CW27 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC166P0CW27 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC166P0CW27 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC166P0CW27 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC166P0CW27 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC166P0CW27 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC166P0CW27 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC166P0CW27 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC166P0CW27 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC166P0CW27 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC166P0CW27 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC166P0CW27 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC166P0CW27 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC166P0CW27 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC166P0CW27 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC166P0CW27 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC166P0CW27 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC166P0CW27 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC166P0CW27 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC166P0CW27 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC166P0CW27 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC166P0CW27 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC166P0CW27 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC166P0CW27 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC166P0CW27 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC166P0CW27 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC166P0CW27 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC166P0CW27 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC166P0CW27 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms