Protein–RNA interactions for Protein: P0C2W7

CT47B1, Cancer/testis antigen 47B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47B1P0C2W7 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
CT47B1P0C2W7 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CT47B1P0C2W7 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CT47B1P0C2W7 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CT47B1P0C2W7 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CT47B1P0C2W7 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CT47B1P0C2W7 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CT47B1P0C2W7 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CT47B1P0C2W7 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CT47B1P0C2W7 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CT47B1P0C2W7 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CT47B1P0C2W7 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CT47B1P0C2W7 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CT47B1P0C2W7 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CT47B1P0C2W7 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CT47B1P0C2W7 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CT47B1P0C2W7 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CT47B1P0C2W7 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CT47B1P0C2W7 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CT47B1P0C2W7 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CT47B1P0C2W7 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CT47B1P0C2W7 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CT47B1P0C2W7 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CT47B1P0C2W7 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CT47B1P0C2W7 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CT47B1P0C2W7 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CT47B1P0C2W7 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CT47B1P0C2W7 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CT47B1P0C2W7 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CT47B1P0C2W7 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CT47B1P0C2W7 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CT47B1P0C2W7 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CT47B1P0C2W7 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CT47B1P0C2W7 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CT47B1P0C2W7 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CT47B1P0C2W7 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CT47B1P0C2W7 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CT47B1P0C2W7 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CT47B1P0C2W7 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CT47B1P0C2W7 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CT47B1P0C2W7 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CT47B1P0C2W7 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CT47B1P0C2W7 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CT47B1P0C2W7 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CT47B1P0C2W7 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CT47B1P0C2W7 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CT47B1P0C2W7 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CT47B1P0C2W7 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CT47B1P0C2W7 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CT47B1P0C2W7 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CT47B1P0C2W7 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CT47B1P0C2W7 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CT47B1P0C2W7 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CT47B1P0C2W7 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CT47B1P0C2W7 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CT47B1P0C2W7 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CT47B1P0C2W7 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CT47B1P0C2W7 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CT47B1P0C2W7 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CT47B1P0C2W7 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CT47B1P0C2W7 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CT47B1P0C2W7 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CT47B1P0C2W7 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CT47B1P0C2W7 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CT47B1P0C2W7 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CT47B1P0C2W7 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CT47B1P0C2W7 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CT47B1P0C2W7 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CT47B1P0C2W7 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CT47B1P0C2W7 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CT47B1P0C2W7 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CT47B1P0C2W7 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CT47B1P0C2W7 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CT47B1P0C2W7 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CT47B1P0C2W7 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CT47B1P0C2W7 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CT47B1P0C2W7 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CT47B1P0C2W7 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CT47B1P0C2W7 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CT47B1P0C2W7 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CT47B1P0C2W7 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CT47B1P0C2W7 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CT47B1P0C2W7 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CT47B1P0C2W7 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CT47B1P0C2W7 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CT47B1P0C2W7 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CT47B1P0C2W7 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CT47B1P0C2W7 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CT47B1P0C2W7 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CT47B1P0C2W7 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CT47B1P0C2W7 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CT47B1P0C2W7 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CT47B1P0C2W7 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CT47B1P0C2W7 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CT47B1P0C2W7 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CT47B1P0C2W7 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CT47B1P0C2W7 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CT47B1P0C2W7 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CT47B1P0C2W7 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CT47B1P0C2W7 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms