Protein–RNA interactions for Protein: P05230

FGF1, Fibroblast growth factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGF1P05230 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FGF1P05230 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FGF1P05230 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FGF1P05230 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FGF1P05230 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FGF1P05230 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FGF1P05230 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FGF1P05230 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FGF1P05230 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FGF1P05230 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FGF1P05230 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FGF1P05230 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FGF1P05230 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FGF1P05230 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FGF1P05230 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FGF1P05230 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FGF1P05230 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
FGF1P05230 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FGF1P05230 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FGF1P05230 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FGF1P05230 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
FGF1P05230 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FGF1P05230 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FGF1P05230 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FGF1P05230 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FGF1P05230 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FGF1P05230 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
FGF1P05230 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FGF1P05230 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FGF1P05230 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FGF1P05230 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FGF1P05230 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FGF1P05230 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FGF1P05230 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FGF1P05230 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FGF1P05230 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FGF1P05230 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FGF1P05230 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FGF1P05230 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FGF1P05230 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FGF1P05230 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FGF1P05230 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FGF1P05230 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
FGF1P05230 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FGF1P05230 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
FGF1P05230 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FGF1P05230 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FGF1P05230 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FGF1P05230 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FGF1P05230 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FGF1P05230 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FGF1P05230 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FGF1P05230 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FGF1P05230 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FGF1P05230 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FGF1P05230 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FGF1P05230 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FGF1P05230 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FGF1P05230 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FGF1P05230 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FGF1P05230 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FGF1P05230 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FGF1P05230 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FGF1P05230 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FGF1P05230 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FGF1P05230 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FGF1P05230 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
FGF1P05230 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FGF1P05230 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FGF1P05230 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FGF1P05230 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
FGF1P05230 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FGF1P05230 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FGF1P05230 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FGF1P05230 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FGF1P05230 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FGF1P05230 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FGF1P05230 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FGF1P05230 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FGF1P05230 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
FGF1P05230 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FGF1P05230 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FGF1P05230 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FGF1P05230 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FGF1P05230 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FGF1P05230 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FGF1P05230 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FGF1P05230 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FGF1P05230 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FGF1P05230 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FGF1P05230 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FGF1P05230 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FGF1P05230 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FGF1P05230 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FGF1P05230 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FGF1P05230 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FGF1P05230 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FGF1P05230 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FGF1P05230 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FGF1P05230 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms