Protein–RNA interactions for Protein: O43497

CACNA1G, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha-1G, humanhuman

Predictions only

Length 2,377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1GO43497 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 AL451069.3-201ENST00000450206 1013 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 AC004522.1-201ENST00000419978 654 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 GTF2I-203ENST00000443166 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CACNA1GO43497 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC14.65□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC14.65□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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