Protein–RNA interactions for Protein: O15516

CLOCK, Circadian locomoter output cycles protein kaput, humanhuman

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLOCKO15516 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLOCKO15516 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLOCKO15516 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLOCKO15516 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CLOCKO15516 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLOCKO15516 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLOCKO15516 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLOCKO15516 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLOCKO15516 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLOCKO15516 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLOCKO15516 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLOCKO15516 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLOCKO15516 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLOCKO15516 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLOCKO15516 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLOCKO15516 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLOCKO15516 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLOCKO15516 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLOCKO15516 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLOCKO15516 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLOCKO15516 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLOCKO15516 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLOCKO15516 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLOCKO15516 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLOCKO15516 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLOCKO15516 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLOCKO15516 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLOCKO15516 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLOCKO15516 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLOCKO15516 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLOCKO15516 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLOCKO15516 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLOCKO15516 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLOCKO15516 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLOCKO15516 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CLOCKO15516 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CLOCKO15516 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLOCKO15516 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLOCKO15516 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLOCKO15516 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLOCKO15516 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLOCKO15516 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLOCKO15516 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLOCKO15516 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLOCKO15516 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLOCKO15516 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLOCKO15516 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLOCKO15516 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLOCKO15516 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLOCKO15516 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLOCKO15516 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLOCKO15516 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLOCKO15516 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLOCKO15516 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLOCKO15516 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLOCKO15516 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLOCKO15516 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLOCKO15516 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLOCKO15516 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLOCKO15516 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CLOCKO15516 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLOCKO15516 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLOCKO15516 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLOCKO15516 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLOCKO15516 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLOCKO15516 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLOCKO15516 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CLOCKO15516 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLOCKO15516 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLOCKO15516 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLOCKO15516 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLOCKO15516 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLOCKO15516 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLOCKO15516 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLOCKO15516 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLOCKO15516 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLOCKO15516 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLOCKO15516 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLOCKO15516 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLOCKO15516 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLOCKO15516 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLOCKO15516 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLOCKO15516 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLOCKO15516 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CLOCKO15516 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CLOCKO15516 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLOCKO15516 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLOCKO15516 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLOCKO15516 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLOCKO15516 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLOCKO15516 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLOCKO15516 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLOCKO15516 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLOCKO15516 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLOCKO15516 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLOCKO15516 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLOCKO15516 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLOCKO15516 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CLOCKO15516 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLOCKO15516 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms