Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms