Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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