Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5K3

PCYT1B, Choline-phosphate cytidylyltransferase B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCYT1BQ9Y5K3 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCYT1BQ9Y5K3 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCYT1BQ9Y5K3 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCYT1BQ9Y5K3 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCYT1BQ9Y5K3 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PCYT1BQ9Y5K3 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PCYT1BQ9Y5K3 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PCYT1BQ9Y5K3 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PCYT1BQ9Y5K3 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PCYT1BQ9Y5K3 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PCYT1BQ9Y5K3 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCYT1BQ9Y5K3 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCYT1BQ9Y5K3 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCYT1BQ9Y5K3 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCYT1BQ9Y5K3 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCYT1BQ9Y5K3 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PCYT1BQ9Y5K3 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCYT1BQ9Y5K3 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCYT1BQ9Y5K3 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCYT1BQ9Y5K3 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCYT1BQ9Y5K3 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCYT1BQ9Y5K3 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCYT1BQ9Y5K3 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCYT1BQ9Y5K3 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PCYT1BQ9Y5K3 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCYT1BQ9Y5K3 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCYT1BQ9Y5K3 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCYT1BQ9Y5K3 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCYT1BQ9Y5K3 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCYT1BQ9Y5K3 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCYT1BQ9Y5K3 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCYT1BQ9Y5K3 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCYT1BQ9Y5K3 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCYT1BQ9Y5K3 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCYT1BQ9Y5K3 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCYT1BQ9Y5K3 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCYT1BQ9Y5K3 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCYT1BQ9Y5K3 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCYT1BQ9Y5K3 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PCYT1BQ9Y5K3 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCYT1BQ9Y5K3 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCYT1BQ9Y5K3 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCYT1BQ9Y5K3 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCYT1BQ9Y5K3 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCYT1BQ9Y5K3 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCYT1BQ9Y5K3 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCYT1BQ9Y5K3 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCYT1BQ9Y5K3 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCYT1BQ9Y5K3 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCYT1BQ9Y5K3 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCYT1BQ9Y5K3 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCYT1BQ9Y5K3 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCYT1BQ9Y5K3 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCYT1BQ9Y5K3 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCYT1BQ9Y5K3 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCYT1BQ9Y5K3 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCYT1BQ9Y5K3 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCYT1BQ9Y5K3 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCYT1BQ9Y5K3 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCYT1BQ9Y5K3 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCYT1BQ9Y5K3 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCYT1BQ9Y5K3 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCYT1BQ9Y5K3 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCYT1BQ9Y5K3 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCYT1BQ9Y5K3 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCYT1BQ9Y5K3 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCYT1BQ9Y5K3 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCYT1BQ9Y5K3 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCYT1BQ9Y5K3 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCYT1BQ9Y5K3 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCYT1BQ9Y5K3 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCYT1BQ9Y5K3 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCYT1BQ9Y5K3 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCYT1BQ9Y5K3 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCYT1BQ9Y5K3 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCYT1BQ9Y5K3 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCYT1BQ9Y5K3 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCYT1BQ9Y5K3 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCYT1BQ9Y5K3 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PCYT1BQ9Y5K3 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PCYT1BQ9Y5K3 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCYT1BQ9Y5K3 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCYT1BQ9Y5K3 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCYT1BQ9Y5K3 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCYT1BQ9Y5K3 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCYT1BQ9Y5K3 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCYT1BQ9Y5K3 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PCYT1BQ9Y5K3 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCYT1BQ9Y5K3 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PCYT1BQ9Y5K3 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCYT1BQ9Y5K3 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCYT1BQ9Y5K3 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCYT1BQ9Y5K3 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCYT1BQ9Y5K3 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCYT1BQ9Y5K3 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCYT1BQ9Y5K3 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCYT1BQ9Y5K3 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCYT1BQ9Y5K3 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCYT1BQ9Y5K3 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCYT1BQ9Y5K3 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms