Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU6

FAM8A1, Protein FAM8A1, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM8A1Q9UBU6 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FAM8A1Q9UBU6 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FAM8A1Q9UBU6 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.5 ms