Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2F8

SIPA1L2, Signal-induced proliferation-associated 1-like protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIPA1L2Q9P2F8 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIPA1L2Q9P2F8 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIPA1L2Q9P2F8 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIPA1L2Q9P2F8 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIPA1L2Q9P2F8 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIPA1L2Q9P2F8 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIPA1L2Q9P2F8 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIPA1L2Q9P2F8 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIPA1L2Q9P2F8 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIPA1L2Q9P2F8 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIPA1L2Q9P2F8 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIPA1L2Q9P2F8 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIPA1L2Q9P2F8 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIPA1L2Q9P2F8 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIPA1L2Q9P2F8 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIPA1L2Q9P2F8 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIPA1L2Q9P2F8 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIPA1L2Q9P2F8 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIPA1L2Q9P2F8 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIPA1L2Q9P2F8 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIPA1L2Q9P2F8 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SIPA1L2Q9P2F8 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SIPA1L2Q9P2F8 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIPA1L2Q9P2F8 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIPA1L2Q9P2F8 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIPA1L2Q9P2F8 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIPA1L2Q9P2F8 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIPA1L2Q9P2F8 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIPA1L2Q9P2F8 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIPA1L2Q9P2F8 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIPA1L2Q9P2F8 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIPA1L2Q9P2F8 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIPA1L2Q9P2F8 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIPA1L2Q9P2F8 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIPA1L2Q9P2F8 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIPA1L2Q9P2F8 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIPA1L2Q9P2F8 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIPA1L2Q9P2F8 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIPA1L2Q9P2F8 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIPA1L2Q9P2F8 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIPA1L2Q9P2F8 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIPA1L2Q9P2F8 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIPA1L2Q9P2F8 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIPA1L2Q9P2F8 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIPA1L2Q9P2F8 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIPA1L2Q9P2F8 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SIPA1L2Q9P2F8 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIPA1L2Q9P2F8 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SIPA1L2Q9P2F8 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIPA1L2Q9P2F8 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIPA1L2Q9P2F8 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIPA1L2Q9P2F8 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIPA1L2Q9P2F8 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIPA1L2Q9P2F8 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIPA1L2Q9P2F8 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIPA1L2Q9P2F8 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIPA1L2Q9P2F8 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIPA1L2Q9P2F8 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIPA1L2Q9P2F8 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIPA1L2Q9P2F8 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIPA1L2Q9P2F8 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIPA1L2Q9P2F8 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIPA1L2Q9P2F8 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIPA1L2Q9P2F8 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIPA1L2Q9P2F8 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIPA1L2Q9P2F8 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIPA1L2Q9P2F8 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIPA1L2Q9P2F8 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIPA1L2Q9P2F8 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIPA1L2Q9P2F8 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIPA1L2Q9P2F8 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIPA1L2Q9P2F8 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIPA1L2Q9P2F8 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIPA1L2Q9P2F8 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIPA1L2Q9P2F8 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIPA1L2Q9P2F8 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIPA1L2Q9P2F8 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIPA1L2Q9P2F8 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIPA1L2Q9P2F8 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIPA1L2Q9P2F8 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIPA1L2Q9P2F8 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIPA1L2Q9P2F8 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIPA1L2Q9P2F8 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIPA1L2Q9P2F8 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIPA1L2Q9P2F8 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIPA1L2Q9P2F8 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIPA1L2Q9P2F8 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIPA1L2Q9P2F8 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIPA1L2Q9P2F8 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIPA1L2Q9P2F8 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SIPA1L2Q9P2F8 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SIPA1L2Q9P2F8 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIPA1L2Q9P2F8 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIPA1L2Q9P2F8 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIPA1L2Q9P2F8 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIPA1L2Q9P2F8 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SIPA1L2Q9P2F8 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIPA1L2Q9P2F8 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIPA1L2Q9P2F8 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIPA1L2Q9P2F8 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms