Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms