Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG8

KCNK4, Potassium channel subfamily K member 4, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK4Q9NYG8 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNK4Q9NYG8 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNK4Q9NYG8 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNK4Q9NYG8 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNK4Q9NYG8 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNK4Q9NYG8 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNK4Q9NYG8 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNK4Q9NYG8 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNK4Q9NYG8 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNK4Q9NYG8 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNK4Q9NYG8 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNK4Q9NYG8 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNK4Q9NYG8 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNK4Q9NYG8 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNK4Q9NYG8 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNK4Q9NYG8 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNK4Q9NYG8 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNK4Q9NYG8 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNK4Q9NYG8 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNK4Q9NYG8 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNK4Q9NYG8 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNK4Q9NYG8 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNK4Q9NYG8 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNK4Q9NYG8 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNK4Q9NYG8 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNK4Q9NYG8 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNK4Q9NYG8 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNK4Q9NYG8 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNK4Q9NYG8 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNK4Q9NYG8 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNK4Q9NYG8 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNK4Q9NYG8 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNK4Q9NYG8 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNK4Q9NYG8 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNK4Q9NYG8 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNK4Q9NYG8 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNK4Q9NYG8 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNK4Q9NYG8 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNK4Q9NYG8 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNK4Q9NYG8 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNK4Q9NYG8 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNK4Q9NYG8 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNK4Q9NYG8 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNK4Q9NYG8 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNK4Q9NYG8 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNK4Q9NYG8 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNK4Q9NYG8 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNK4Q9NYG8 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNK4Q9NYG8 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNK4Q9NYG8 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNK4Q9NYG8 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNK4Q9NYG8 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNK4Q9NYG8 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNK4Q9NYG8 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNK4Q9NYG8 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNK4Q9NYG8 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNK4Q9NYG8 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNK4Q9NYG8 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNK4Q9NYG8 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNK4Q9NYG8 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNK4Q9NYG8 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNK4Q9NYG8 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNK4Q9NYG8 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNK4Q9NYG8 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNK4Q9NYG8 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNK4Q9NYG8 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNK4Q9NYG8 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNK4Q9NYG8 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNK4Q9NYG8 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNK4Q9NYG8 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNK4Q9NYG8 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNK4Q9NYG8 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNK4Q9NYG8 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNK4Q9NYG8 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNK4Q9NYG8 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms