Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms