Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms