Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B4

CLMP, CXADR-like membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMPQ9H6B4 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.1 ms