Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms