Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D4

ZNF518B, Zinc finger protein 518B, humanhuman

Predictions only

Length 1,074 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF518BQ9C0D4 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ZNF518BQ9C0D4 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ZNF518BQ9C0D4 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ZNF518BQ9C0D4 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ZNF518BQ9C0D4 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
ZNF518BQ9C0D4 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ZNF518BQ9C0D4 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZNF518BQ9C0D4 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZNF518BQ9C0D4 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZNF518BQ9C0D4 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ZNF518BQ9C0D4 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZNF518BQ9C0D4 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZNF518BQ9C0D4 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZNF518BQ9C0D4 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZNF518BQ9C0D4 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZNF518BQ9C0D4 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZNF518BQ9C0D4 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ZNF518BQ9C0D4 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZNF518BQ9C0D4 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZNF518BQ9C0D4 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZNF518BQ9C0D4 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZNF518BQ9C0D4 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ZNF518BQ9C0D4 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZNF518BQ9C0D4 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZNF518BQ9C0D4 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZNF518BQ9C0D4 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZNF518BQ9C0D4 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZNF518BQ9C0D4 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZNF518BQ9C0D4 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZNF518BQ9C0D4 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZNF518BQ9C0D4 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ZNF518BQ9C0D4 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZNF518BQ9C0D4 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZNF518BQ9C0D4 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZNF518BQ9C0D4 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZNF518BQ9C0D4 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZNF518BQ9C0D4 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF518BQ9C0D4 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF518BQ9C0D4 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF518BQ9C0D4 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF518BQ9C0D4 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF518BQ9C0D4 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF518BQ9C0D4 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF518BQ9C0D4 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF518BQ9C0D4 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF518BQ9C0D4 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF518BQ9C0D4 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF518BQ9C0D4 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF518BQ9C0D4 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF518BQ9C0D4 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF518BQ9C0D4 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF518BQ9C0D4 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF518BQ9C0D4 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF518BQ9C0D4 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF518BQ9C0D4 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF518BQ9C0D4 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF518BQ9C0D4 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF518BQ9C0D4 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF518BQ9C0D4 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF518BQ9C0D4 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF518BQ9C0D4 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF518BQ9C0D4 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF518BQ9C0D4 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF518BQ9C0D4 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF518BQ9C0D4 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF518BQ9C0D4 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF518BQ9C0D4 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF518BQ9C0D4 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF518BQ9C0D4 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF518BQ9C0D4 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF518BQ9C0D4 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF518BQ9C0D4 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF518BQ9C0D4 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF518BQ9C0D4 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF518BQ9C0D4 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF518BQ9C0D4 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF518BQ9C0D4 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF518BQ9C0D4 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF518BQ9C0D4 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF518BQ9C0D4 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF518BQ9C0D4 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF518BQ9C0D4 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF518BQ9C0D4 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF518BQ9C0D4 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF518BQ9C0D4 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF518BQ9C0D4 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNF518BQ9C0D4 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNF518BQ9C0D4 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNF518BQ9C0D4 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNF518BQ9C0D4 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNF518BQ9C0D4 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNF518BQ9C0D4 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNF518BQ9C0D4 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNF518BQ9C0D4 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNF518BQ9C0D4 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNF518BQ9C0D4 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNF518BQ9C0D4 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNF518BQ9C0D4 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNF518BQ9C0D4 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNF518BQ9C0D4 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms