Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
C9orf16Q9BUW7 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
C9orf16Q9BUW7 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms