Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF0

RAB3IP, Rab-3A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IPQ96QF0 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms