Protein–RNA interactions for Protein: Q96FE5

LINGO1, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain-containing nogo receptor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINGO1Q96FE5 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINGO1Q96FE5 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINGO1Q96FE5 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINGO1Q96FE5 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINGO1Q96FE5 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINGO1Q96FE5 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINGO1Q96FE5 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINGO1Q96FE5 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINGO1Q96FE5 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINGO1Q96FE5 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINGO1Q96FE5 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINGO1Q96FE5 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINGO1Q96FE5 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINGO1Q96FE5 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINGO1Q96FE5 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINGO1Q96FE5 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINGO1Q96FE5 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINGO1Q96FE5 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINGO1Q96FE5 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINGO1Q96FE5 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINGO1Q96FE5 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINGO1Q96FE5 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINGO1Q96FE5 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LINGO1Q96FE5 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LINGO1Q96FE5 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LINGO1Q96FE5 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINGO1Q96FE5 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINGO1Q96FE5 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINGO1Q96FE5 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINGO1Q96FE5 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINGO1Q96FE5 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINGO1Q96FE5 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINGO1Q96FE5 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINGO1Q96FE5 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINGO1Q96FE5 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINGO1Q96FE5 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINGO1Q96FE5 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINGO1Q96FE5 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINGO1Q96FE5 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINGO1Q96FE5 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINGO1Q96FE5 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINGO1Q96FE5 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINGO1Q96FE5 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINGO1Q96FE5 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINGO1Q96FE5 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINGO1Q96FE5 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINGO1Q96FE5 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINGO1Q96FE5 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINGO1Q96FE5 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINGO1Q96FE5 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINGO1Q96FE5 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINGO1Q96FE5 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LINGO1Q96FE5 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINGO1Q96FE5 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINGO1Q96FE5 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINGO1Q96FE5 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINGO1Q96FE5 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LINGO1Q96FE5 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINGO1Q96FE5 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINGO1Q96FE5 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINGO1Q96FE5 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINGO1Q96FE5 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINGO1Q96FE5 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINGO1Q96FE5 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LINGO1Q96FE5 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINGO1Q96FE5 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINGO1Q96FE5 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINGO1Q96FE5 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINGO1Q96FE5 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINGO1Q96FE5 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LINGO1Q96FE5 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINGO1Q96FE5 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINGO1Q96FE5 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINGO1Q96FE5 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINGO1Q96FE5 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINGO1Q96FE5 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINGO1Q96FE5 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINGO1Q96FE5 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINGO1Q96FE5 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINGO1Q96FE5 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINGO1Q96FE5 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINGO1Q96FE5 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINGO1Q96FE5 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINGO1Q96FE5 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINGO1Q96FE5 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINGO1Q96FE5 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINGO1Q96FE5 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINGO1Q96FE5 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINGO1Q96FE5 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINGO1Q96FE5 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINGO1Q96FE5 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINGO1Q96FE5 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LINGO1Q96FE5 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LINGO1Q96FE5 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LINGO1Q96FE5 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINGO1Q96FE5 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINGO1Q96FE5 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LINGO1Q96FE5 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINGO1Q96FE5 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINGO1Q96FE5 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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