Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms