Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW4

ZNF248, Zinc finger protein 248, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248Q8NDW4 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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ZNF248Q8NDW4 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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ZNF248Q8NDW4 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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ZNF248Q8NDW4 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF248Q8NDW4 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF248Q8NDW4 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF248Q8NDW4 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF248Q8NDW4 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF248Q8NDW4 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF248Q8NDW4 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF248Q8NDW4 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF248Q8NDW4 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF248Q8NDW4 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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ZNF248Q8NDW4 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF248Q8NDW4 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF248Q8NDW4 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF248Q8NDW4 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF248Q8NDW4 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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ZNF248Q8NDW4 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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ZNF248Q8NDW4 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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ZNF248Q8NDW4 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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ZNF248Q8NDW4 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF248Q8NDW4 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF248Q8NDW4 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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ZNF248Q8NDW4 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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ZNF248Q8NDW4 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF248Q8NDW4 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF248Q8NDW4 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF248Q8NDW4 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF248Q8NDW4 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF248Q8NDW4 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF248Q8NDW4 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF248Q8NDW4 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF248Q8NDW4 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF248Q8NDW4 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF248Q8NDW4 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF248Q8NDW4 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF248Q8NDW4 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF248Q8NDW4 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF248Q8NDW4 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF248Q8NDW4 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF248Q8NDW4 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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