Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6V4

C10orf53, UPF0728 protein C10orf53, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf53Q8N6V4 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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C10orf53Q8N6V4 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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C10orf53Q8N6V4 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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C10orf53Q8N6V4 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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C10orf53Q8N6V4 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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C10orf53Q8N6V4 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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C10orf53Q8N6V4 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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C10orf53Q8N6V4 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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C10orf53Q8N6V4 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C10orf53Q8N6V4 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C10orf53Q8N6V4 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C10orf53Q8N6V4 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C10orf53Q8N6V4 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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C10orf53Q8N6V4 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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C10orf53Q8N6V4 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C10orf53Q8N6V4 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C10orf53Q8N6V4 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C10orf53Q8N6V4 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C10orf53Q8N6V4 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C10orf53Q8N6V4 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C10orf53Q8N6V4 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
C10orf53Q8N6V4 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C10orf53Q8N6V4 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C10orf53Q8N6V4 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C10orf53Q8N6V4 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C10orf53Q8N6V4 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C10orf53Q8N6V4 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C10orf53Q8N6V4 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C10orf53Q8N6V4 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C10orf53Q8N6V4 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C10orf53Q8N6V4 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C10orf53Q8N6V4 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C10orf53Q8N6V4 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C10orf53Q8N6V4 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
C10orf53Q8N6V4 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C10orf53Q8N6V4 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C10orf53Q8N6V4 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C10orf53Q8N6V4 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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