Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7K0

CMC1, COX assembly mitochondrial protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMC1Q7Z7K0 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CMC1Q7Z7K0 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CMC1Q7Z7K0 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CMC1Q7Z7K0 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CMC1Q7Z7K0 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CMC1Q7Z7K0 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CMC1Q7Z7K0 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CMC1Q7Z7K0 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CMC1Q7Z7K0 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CMC1Q7Z7K0 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CMC1Q7Z7K0 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CMC1Q7Z7K0 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CMC1Q7Z7K0 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CMC1Q7Z7K0 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CMC1Q7Z7K0 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CMC1Q7Z7K0 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CMC1Q7Z7K0 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CMC1Q7Z7K0 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CMC1Q7Z7K0 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CMC1Q7Z7K0 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CMC1Q7Z7K0 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CMC1Q7Z7K0 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CMC1Q7Z7K0 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CMC1Q7Z7K0 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CMC1Q7Z7K0 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CMC1Q7Z7K0 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CMC1Q7Z7K0 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CMC1Q7Z7K0 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CMC1Q7Z7K0 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CMC1Q7Z7K0 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CMC1Q7Z7K0 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CMC1Q7Z7K0 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CMC1Q7Z7K0 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CMC1Q7Z7K0 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CMC1Q7Z7K0 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CMC1Q7Z7K0 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CMC1Q7Z7K0 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CMC1Q7Z7K0 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CMC1Q7Z7K0 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CMC1Q7Z7K0 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CMC1Q7Z7K0 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CMC1Q7Z7K0 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CMC1Q7Z7K0 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CMC1Q7Z7K0 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CMC1Q7Z7K0 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CMC1Q7Z7K0 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CMC1Q7Z7K0 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CMC1Q7Z7K0 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CMC1Q7Z7K0 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CMC1Q7Z7K0 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CMC1Q7Z7K0 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CMC1Q7Z7K0 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CMC1Q7Z7K0 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CMC1Q7Z7K0 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMC1Q7Z7K0 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMC1Q7Z7K0 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMC1Q7Z7K0 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CMC1Q7Z7K0 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMC1Q7Z7K0 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMC1Q7Z7K0 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMC1Q7Z7K0 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMC1Q7Z7K0 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMC1Q7Z7K0 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMC1Q7Z7K0 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMC1Q7Z7K0 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CMC1Q7Z7K0 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMC1Q7Z7K0 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMC1Q7Z7K0 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMC1Q7Z7K0 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMC1Q7Z7K0 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMC1Q7Z7K0 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMC1Q7Z7K0 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMC1Q7Z7K0 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMC1Q7Z7K0 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMC1Q7Z7K0 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMC1Q7Z7K0 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMC1Q7Z7K0 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMC1Q7Z7K0 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CMC1Q7Z7K0 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMC1Q7Z7K0 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CMC1Q7Z7K0 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CMC1Q7Z7K0 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMC1Q7Z7K0 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMC1Q7Z7K0 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CMC1Q7Z7K0 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CMC1Q7Z7K0 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CMC1Q7Z7K0 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMC1Q7Z7K0 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMC1Q7Z7K0 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMC1Q7Z7K0 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMC1Q7Z7K0 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMC1Q7Z7K0 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMC1Q7Z7K0 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMC1Q7Z7K0 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMC1Q7Z7K0 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMC1Q7Z7K0 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMC1Q7Z7K0 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMC1Q7Z7K0 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMC1Q7Z7K0 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMC1Q7Z7K0 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms