Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC14.07□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
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C9orf135Q5VTT2 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
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