Protein–RNA interactions for Protein: Q5UIP0

RIF1, Telomere-associated protein RIF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIF1Q5UIP0 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 ANAPC11-221ENST00000584314 559 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 FKBP1B-205ENST00000452109 953 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 AL138720.1-201ENST00000629853 778 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms