Protein–RNA interactions for Protein: Q53EV4

LRRC23, Leucine-rich repeat-containing protein 23, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC23Q53EV4 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms