Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTXN3Q4LDR2 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTXN3Q4LDR2 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTXN3Q4LDR2 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTXN3Q4LDR2 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CTXN3Q4LDR2 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTXN3Q4LDR2 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTXN3Q4LDR2 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTXN3Q4LDR2 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTXN3Q4LDR2 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTXN3Q4LDR2 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTXN3Q4LDR2 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTXN3Q4LDR2 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTXN3Q4LDR2 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTXN3Q4LDR2 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTXN3Q4LDR2 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTXN3Q4LDR2 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTXN3Q4LDR2 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTXN3Q4LDR2 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTXN3Q4LDR2 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTXN3Q4LDR2 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTXN3Q4LDR2 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTXN3Q4LDR2 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTXN3Q4LDR2 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTXN3Q4LDR2 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CTXN3Q4LDR2 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTXN3Q4LDR2 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTXN3Q4LDR2 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CTXN3Q4LDR2 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTXN3Q4LDR2 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTXN3Q4LDR2 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CTXN3Q4LDR2 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTXN3Q4LDR2 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTXN3Q4LDR2 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTXN3Q4LDR2 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTXN3Q4LDR2 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CTXN3Q4LDR2 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTXN3Q4LDR2 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTXN3Q4LDR2 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CTXN3Q4LDR2 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTXN3Q4LDR2 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTXN3Q4LDR2 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTXN3Q4LDR2 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTXN3Q4LDR2 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTXN3Q4LDR2 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTXN3Q4LDR2 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTXN3Q4LDR2 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTXN3Q4LDR2 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTXN3Q4LDR2 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTXN3Q4LDR2 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTXN3Q4LDR2 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTXN3Q4LDR2 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CTXN3Q4LDR2 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTXN3Q4LDR2 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTXN3Q4LDR2 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTXN3Q4LDR2 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTXN3Q4LDR2 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTXN3Q4LDR2 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTXN3Q4LDR2 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTXN3Q4LDR2 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTXN3Q4LDR2 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTXN3Q4LDR2 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTXN3Q4LDR2 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTXN3Q4LDR2 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTXN3Q4LDR2 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTXN3Q4LDR2 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTXN3Q4LDR2 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTXN3Q4LDR2 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTXN3Q4LDR2 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTXN3Q4LDR2 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTXN3Q4LDR2 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTXN3Q4LDR2 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTXN3Q4LDR2 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTXN3Q4LDR2 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTXN3Q4LDR2 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTXN3Q4LDR2 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTXN3Q4LDR2 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTXN3Q4LDR2 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTXN3Q4LDR2 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTXN3Q4LDR2 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTXN3Q4LDR2 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTXN3Q4LDR2 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
CTXN3Q4LDR2 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
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