Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
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FAM187BQ17R55 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
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FAM187BQ17R55 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
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FAM187BQ17R55 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
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FAM187BQ17R55 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
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FAM187BQ17R55 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
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FAM187BQ17R55 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
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FAM187BQ17R55 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
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FAM187BQ17R55 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
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FAM187BQ17R55 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
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FAM187BQ17R55 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
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FAM187BQ17R55 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
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FAM187BQ17R55 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
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FAM187BQ17R55 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
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FAM187BQ17R55 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FAM187BQ17R55 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FAM187BQ17R55 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
FAM187BQ17R55 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FAM187BQ17R55 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
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FAM187BQ17R55 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM187BQ17R55 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM187BQ17R55 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM187BQ17R55 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM187BQ17R55 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM187BQ17R55 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM187BQ17R55 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM187BQ17R55 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM187BQ17R55 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM187BQ17R55 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM187BQ17R55 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM187BQ17R55 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM187BQ17R55 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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FAM187BQ17R55 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM187BQ17R55 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM187BQ17R55 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM187BQ17R55 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM187BQ17R55 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
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