Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
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