Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FXNQ16595 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FXNQ16595 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FXNQ16595 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FXNQ16595 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FXNQ16595 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FXNQ16595 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FXNQ16595 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FXNQ16595 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FXNQ16595 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FXNQ16595 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
FXNQ16595 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FXNQ16595 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FXNQ16595 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FXNQ16595 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FXNQ16595 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FXNQ16595 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FXNQ16595 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FXNQ16595 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FXNQ16595 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FXNQ16595 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FXNQ16595 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FXNQ16595 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FXNQ16595 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FXNQ16595 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FXNQ16595 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FXNQ16595 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FXNQ16595 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FXNQ16595 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
FXNQ16595 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FXNQ16595 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FXNQ16595 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FXNQ16595 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FXNQ16595 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FXNQ16595 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FXNQ16595 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FXNQ16595 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FXNQ16595 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FXNQ16595 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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FXNQ16595 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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FXNQ16595 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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FXNQ16595 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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FXNQ16595 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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FXNQ16595 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FXNQ16595 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FXNQ16595 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FXNQ16595 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FXNQ16595 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FXNQ16595 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FXNQ16595 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FXNQ16595 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FXNQ16595 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FXNQ16595 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FXNQ16595 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FXNQ16595 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FXNQ16595 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FXNQ16595 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FXNQ16595 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FXNQ16595 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FXNQ16595 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FXNQ16595 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FXNQ16595 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FXNQ16595 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FXNQ16595 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FXNQ16595 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FXNQ16595 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FXNQ16595 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FXNQ16595 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FXNQ16595 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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