Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms