Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC13.83□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC13.82□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC13.82□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms