Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SSX1Q16384 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SSX1Q16384 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SSX1Q16384 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
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SSX1Q16384 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
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SSX1Q16384 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SSX1Q16384 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
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SSX1Q16384 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
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SSX1Q16384 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
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