Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms