Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 APOBEC3H-201ENST00000348946 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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