Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 LINC02536-201ENST00000625799 625 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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