Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
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PTPRKQ15262 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRKQ15262 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
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