Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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BRD3Q15059 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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BRD3Q15059 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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BRD3Q15059 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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BRD3Q15059 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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BRD3Q15059 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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BRD3Q15059 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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BRD3Q15059 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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