Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 ITGB5-AS1-201ENST00000495917 460 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 AC008147.4-201ENST00000617570 1204 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 SMIM26-201ENST00000411646 505 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 SMIM26-202ENST00000435844 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 AL117351.1-201ENST00000438864 766 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 AP002336.2-201ENST00000528607 539 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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LAPTM4AQ15012 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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