Protein–RNA interactions for Protein: Q14213

EBI3, Interleukin-27 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBI3Q14213 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC12.5□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC12.5□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.5□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
EBI3Q14213 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82 ms