Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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CKAP5Q14008 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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CKAP5Q14008 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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CKAP5Q14008 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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CKAP5Q14008 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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CKAP5Q14008 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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CKAP5Q14008 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
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CKAP5Q14008 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
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CKAP5Q14008 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
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CKAP5Q14008 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms