Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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